基于高通量测序研究慢性HIV-1感染患者IgM及IgG抗体组库特征 | VS推荐

中国病毒学英文版

中国病毒学英文版IF:4.327

公众号ID：virologica

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作者:

田小龙，洪斌斌，朱晓艺，孔德生，闻玉梅，吴艳玲，马丽英，应天雷

单位:

复旦大学上海医学院基础医学院，教育部/卫健委医学分子病毒学重点实验室，上海
福建医科大学第二附属医院中心实验室，泉州
中国疾病预防控制中心国家艾滋病/性病预防控制中心，传染病预防控制国家重点实验室，北京
上海合成免疫工程技术研究中心，上海
上海市肺部炎症与损伤重点实验室，上海

摘要:

抗体组库（antibody repertoires）的高通量测序前所未有地提高了我们大规模表征抗体组库的能力。然而，目前只有少数研究探讨了慢性 HIV-1感染对人抗体组库的影响，而且受到测序深度和通量不足的限制出现了相互矛盾的结论。为了更好地了解 HIV-1感染如何影响体液免疫系统，在本研究中，我们系统地分析了 HIV-1感染患者的 IgM (HIV-IgM) 和 IgG (HIV-IgG) 重链抗体组库之间的差异，以及HIV-1患者和健康供体 (HH) 的IgM抗体组库之间的差异。结果发现，在 HIV-IgM 和 HIV-IgG 库中，共有的克隆占比极低，并且 HIV-IgG中克隆的多样性显著降低，后者CDR1和CDR2的体细胞突变率高于前者。HIV-IgM 中 CDR3 区域的平均长度显著长于HH 库，这可能是由于前者中出现了大量新的 VDJ 重排模式，且对 IGHJ6 的偏好性使用。此外，一些B细胞克隆型中存在大量克隆，并且在 HIV-IgG 的克隆型谱系中检测到体细胞变异，表明其具有潜在的HIV-1中和活性。对 HIV-IgG 和 HIV-IgM 库的深入表征丰富了我们对 HIV-1 感染对人类抗体库的深远影响的认知，并可能对发现治疗性抗体具有实用价值。